Amplificação cruzada e padronização de marcadores microssatélites em Colossoma macropomum (tambaqui)
DOI:
https://doi.org/10.5216/rbn.v5i2.9821Palabras clave:
Marcadores genéticos, peixe, transferibilidadeResumen
A espécie Colossoma macropomum (tambaqui), muito cultivada em piscicultura por todo o Brasil, já apresenta perda de variabilidade genética em alguns estoques. O objetivo deste trabalho foitestar para esta espécie a amplificação cruzada de 52 locos microsatélites desenvolvidos originalmente para outras espécies da ictiofauna. Para tanto, foram coletados indivíduos de tambaqui de pisciculturada região de Goiânia, Brasil, e a extração do DNA para amplificação foi feita a partir de tecido muscular. Os testes de amplificação cruzada foram realizados alterando as temperaturas de cada loco, buscando a padronização da amplificação. Dos 52 locos testados, 16 apresentaram resultados satisfatórios de amplificação cruzada, o que permitiu a definição dos genótipos. Esses resultados indicam que existeum grande potencial de transferibilidade de marcadores microssatélites entre espécies diferentes da ictiofauna. Esses marcadores podem ser usados em estudos genético-populacionais desta espécie nosprogramas de conservação, manejo e melhoramento deste recurso pesqueiro.
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Referencias
Araújo, L. C. & M. Gouding. 1998. Os frutos do tambaqui: ecologia, conservação e cultivo na Amazônia. Sociedade Civil Mamirauá/CNPq, Brasília, DF, 186 p.
Barbosa, A. C. D. R., T. C. Corrêa, F. Galzerani, P. M. Galetti-Jr. & T. Hatakana. 2006. Thirteen polymorphic microsatellite loci in Neotropical fish Prochilodus argenteus (Characiformes, Prochilodontidae). Mol. Ecol. Notes 6: 936-938.
Brondani, C., P. H. N. Rangel, T. C. O. Borba & R. P. V. Brondani. 2003. Transferability of microsatellite and sequence tagged site markers in Oryza species. Hereditas 138: 187-192.
Calcagnotto, D., M. Russello & R. De-Salle. 2001. Isolation and characterization of microsatellite loci in Piaractus mesopotamicus and their applicability in other Serrasalminae fish. Mol. Ecol. Notes 1: 245-247.
Calcagnotto, D. & S. A. Toledo-Filho. 2000. Loss of genetic variability at the transferrin locus in five hatchery stocks of tambaqui (Colossoma macropomum). Genet. Mol. Biol. 23: 127-130.
Carreras-Carbonell, J., E. MacPherson & M. Pascual. 2007. Utility of pairwise mtDNA genetic distances for predicting cross species microsatellite amplification and polymorphism success in fishes. Conserv. Genet. 9: 181-190.
Carvalho-Costa, L. F., T. Hatakana & P. M. Galetti-Jr. 2006. Isolation and characterization of polymorphic microsatellite markers in the migratory freshwater fish Prochilodus costatus. Mol. Ecol. Notes 6: 818-819.
Creste, S., A. Tulmann Neto & A. Figueira. 2001. Detection of single sequence repeat polymorphisms in denaturing polyacrylamide sequencing gels by silver staining. Plant Mol. Biol. Rep. 19: 299-306.
Gao, L. Z., C. H. Zhang & J. Z. Jia. 2005. Crossspecies transferability of rice microsatelites in its wild relatives and the potential for conservation genetic studies. Genet. Resour. Crop Evol. 52: 931-940.
Grattapaglia, D., R. P. V. Brondani & C. Brondani. 2008. Manual prático para desenvolvimento de marcadores microssatélites em plantas. Embrapa, Brasília, DF.
Gupta, P. K. & R. K. Varshney. 2000. The development and use of microsatellite markers for genetic analysis and plant breeding with emphasis on bread wheat. Euphytica 113: 163-185.
Hatanaka, T., F. Henrique-Silva & P. M. Galetti-Jr. 2006. Population substructuring in a migratory freshwater fish Prochilodus argenteus (Characiformes, Prochilodontidae) from the São Francisco River. Genética 126: 153-159.
IBAMA. Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis. Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento, Secretaria Especial de Aqüicultura e Pesca. 2005. Produção brasileira de aqüicultura continental. Brasília, DF.
Katzir, N., Y. Danin-Poleg, G. Tzuri, Z. Karchi, U. Lavi & P. B. Cregan. 1996. Length polymorphism and homologies of microsatellites in several Cucurbitaceae species. Theor. Appl. Genet. 93: 1282-1290.
Liao, X., D. Wang, X. Yu, W. Li, L. Cheng, J. Wang & J. Tong. 2007. Characterization of novel microsatellite loci in rare minnow (Gobiocypris rarus) and amplification in closely related species in Gobioninae. Conserv. Genet. 8: 1003-1007.
Magalhães, A. L. B., R. F. Andrade, T. F. Ratton & M. F. G. Brito. 2002. Ocorrência da truta arco-íris Oncorhynchus mykiss (Walbaum, 1792) (Pisces: Salmonidae) no alto rio Aiuruóca e tributários, bacia do rio Grande, Minas Gerais, Brasil. Bol. Museu Biol. Mello Leitão 14: 35-42.
Matsuoka, Y., S. E. Mitchell & S. Kresovich, M. Goodman & J. Doebley. 2002. Microsatellites in Zea-variability, patterns of mutations, and use for evolutionary studies. Theor. Appl. Genet. 104: 436-450.
Morelli, K. A., E. Revaldaves, C. Oliveira & F. Foresti. 2007. Isolation and characterization of eight microsatellite loci in Leporinus macrocephalus (Characiformes: Anostomidae) and cross-species amplification. Mol. Ecol. Notes 7: 32-34.
Moretzohn, M. C. 2006. Desenvolvimento e mapeamento de marcadores microssatélites e identificação de QTLs ligados à produtividade e à resistência à mancha preta em Arachis sp. Tese de Doutorado. Universidade de Brasília, Brasília, DF.
Paterson, I. G., E. Crispo, M. T. Kinnison, A. P. Hendry & P. Bentzen. 2005. Characterization of tetranucleotide microsatellite markers in guppy (Poecilia reticulata). Mol. Ecol. Notes 5: 269-271.
Plieske, J. & D. Struss. 2001. Microsatellite markers for genome analysis in Brassica L. development in Brassica napus and abundance in Brassicaceae species. Theor. Appl. Genet. 102: 689-694.
Saha, C. M., J. D. Cooper, M. A. Rouf Mian, K. Chekhovskiy & G. D. May Theor. 2006. Tall fescue genomic SSR markers: development and transferability across multiple grass species. Appl. Genet. 113: 1449-1458.
Saracura, V. F. & N. Casagnolli. 1990. Comparação do desempenho entre os alevinos de pacu (Piaractus mesopotamicus) e híbridos de pacu e tambaqui (Colossoma macropomum). Ciênc. Zootéc. 5: 17-19.
Simon, J. C., S. Baumann, P. Sunnucks, P. D. N. Hebert, J. S. Pierre Gallic & C. A. Dedryver. 1999. Reproductive mode and population genetic structure of the cereal aphid Sitobion avenae studied using phenotypic and microsatellite markers. Mol. Ecol. 8: 531-545.
Strecker, U. 2003. Polymorphic microsatelites isolated from the cave fish Astyanax fasciatus. Mol. Ecol. Notes 3: 150-151.
Villacorta-Correa, M. A. & U. Saint-Paul. 1999. Structural indexes and sexual maturity of tambaqui Colossoma macropomum (Cuvier, 1818) (Characiformes: characidae) in central Amazon, Brazil. Rev. Bras. Biol. 59: 637-652.
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